Un manuscrit ancien a disparu. Le monde moderne court à sa perte. Seuls Josh et Sophie sont capables de sauver l'humanité. Les voilà sur le point d'entrer dans la plus grande légende de tous les temps !

Nicolas Flamel et les jumeaux se rendent à Londres où le roi Gilgamesh doit leur enseigner la magie élémentaire de l'eau. De leur côté les Ténébreux ordonnent à Dee et Machiavel de se débarrasser d'eux au plus vite sans quoi ils se verront infliger les pires souffrances. Ils partent alors pour Alcatraz où Pernelle Flamel est retenue prisonnière.